MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015851	CTG	2	6	130798	130803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783755
2502	NC_015851	GGC	2	6	130890	130895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783755
2503	NC_015851	AGG	2	6	130966	130971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783755
2504	NC_015851	ACG	2	6	130976	130981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783755
2505	NC_015851	GGA	2	6	130996	131001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783755
2506	NC_015851	GAA	2	6	131094	131099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015851	GCG	2	6	131235	131240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_015851	GT	3	6	131262	131267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015851	TCA	2	6	131339	131344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783756
2510	NC_015851	GACG	2	8	131442	131449	25 %	0 %	50 %	25 %	340783756
2511	NC_015851	GAT	2	6	131488	131493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783756
2512	NC_015851	TCG	2	6	131495	131500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783756
2513	NC_015851	T	6	6	131514	131519	0 %	100 %	0 %	0 %	340783756
2514	NC_015851	CTT	3	9	131535	131543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783756
2515	NC_015851	TGG	2	6	131696	131701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783756
2516	NC_015851	TGA	2	6	131709	131714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783756
2517	NC_015851	CG	3	6	131758	131763	0 %	0 %	50 %	50 %	340783756
2518	NC_015851	CGG	2	6	131843	131848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783756
2519	NC_015851	TGCATG	2	12	131849	131860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783756
2520	NC_015851	GC	3	6	131949	131954	0 %	0 %	50 %	50 %	340783756
2521	NC_015851	CCA	3	9	131969	131977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783757
2522	NC_015851	CTT	2	6	132005	132010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783757
2523	NC_015851	ACT	2	6	132091	132096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783757
2524	NC_015851	CCG	2	6	132124	132129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783757
2525	NC_015851	GCG	2	6	132152	132157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783757
2526	NC_015851	GT	3	6	132207	132212	0 %	50 %	50 %	0 %	340783757
2527	NC_015851	CGA	2	6	132214	132219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783757
2528	NC_015851	GCG	2	6	132261	132266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783757
2529	NC_015851	TC	3	6	132287	132292	0 %	50 %	0 %	50 %	340783757
2530	NC_015851	TAG	2	6	132301	132306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783757
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2532	NC_015851	CGG	3	9	132463	132471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783757
2533	NC_015851	GGCACC	2	12	132493	132504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340783757
2534	NC_015851	CCG	2	6	132515	132520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783757
2535	NC_015851	GC	3	6	132575	132580	0 %	0 %	50 %	50 %	340783757
2536	NC_015851	GATC	2	8	132596	132603	25 %	25 %	25 %	25 %	340783757
2537	NC_015851	CGT	2	6	132617	132622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783757
2538	NC_015851	TGA	2	6	132694	132699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783757
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2540	NC_015851	TC	3	6	132770	132775	0 %	50 %	0 %	50 %	340783757
2541	NC_015851	CGG	2	6	132788	132793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783757
2542	NC_015851	CCGT	2	8	132815	132822	0 %	25 %	25 %	50 %	340783757
2543	NC_015851	GGA	2	6	132994	132999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783757
2544	NC_015851	TTC	2	6	133021	133026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783757
2545	NC_015851	CGA	2	6	133042	133047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783757
2546	NC_015851	CATC	2	8	133079	133086	25 %	25 %	0 %	50 %	340783757
2547	NC_015851	CAG	2	6	133128	133133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783757
2548	NC_015851	A	6	6	133210	133215	100 %	0 %	0 %	0 %	340783757
2549	NC_015851	CCG	2	6	133268	133273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783757
2550	NC_015851	CCG	3	9	133288	133296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783757
2551	NC_015851	CGA	2	6	133345	133350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783757
2552	NC_015851	CGT	2	6	133604	133609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_015851	GAT	2	6	133676	133681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783758
2554	NC_015851	AGC	2	6	133710	133715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783758
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2556	NC_015851	CAGC	2	8	133846	133853	25 %	0 %	25 %	50 %	340783759
2557	NC_015851	CCAGG	2	10	133858	133867	20 %	0 %	40 %	40 %	340783759
2558	NC_015851	GGC	2	6	133968	133973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783759
2559	NC_015851	GCA	2	6	133997	134002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783759
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2561	NC_015851	CAT	2	6	134048	134053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_015851	GCG	2	6	134143	134148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783760
2563	NC_015851	AGC	2	6	134175	134180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783760
2564	NC_015851	GAT	2	6	134210	134215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783760
2565	NC_015851	GGT	2	6	134235	134240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783760
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2569	NC_015851	TCG	2	6	134448	134453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783760
2570	NC_015851	GAT	2	6	134471	134476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783760
2571	NC_015851	GCT	2	6	134540	134545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783760
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2573	NC_015851	GGT	2	6	134588	134593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783760
2574	NC_015851	TTGC	2	8	134657	134664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_015851	GTT	2	6	134666	134671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_015851	CCCAGC	2	12	134832	134843	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340783761
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2580	NC_015851	CGG	2	6	134910	134915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783761
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2587	NC_015851	GAG	2	6	135275	135280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783761
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2589	NC_015851	AAG	2	6	135318	135323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783761
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2592	NC_015851	CGT	2	6	135480	135485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
2593	NC_015851	TGG	2	6	135525	135530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783762
2594	NC_015851	GTT	2	6	135540	135545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783762
2595	NC_015851	T	6	6	135621	135626	0 %	100 %	0 %	0 %	340783762
2596	NC_015851	TCG	2	6	135662	135667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
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2601	NC_015851	ATG	4	12	135821	135832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783762
2602	NC_015851	GGT	2	6	135834	135839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783762
2603	NC_015851	TCG	2	6	135863	135868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
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2606	NC_015851	CG	5	10	136161	136170	0 %	0 %	50 %	50 %	340783762
2607	NC_015851	GGC	2	6	136171	136176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783762
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2610	NC_015851	CTCG	2	8	136276	136283	0 %	25 %	25 %	50 %	340783762
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2622	NC_015851	GAC	2	6	136942	136947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783762
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2989	NC_015851	AAC	2	6	155217	155222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783787
2990	NC_015851	GCT	2	6	155238	155243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
2991	NC_015851	TGC	2	6	155269	155274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
2992	NC_015851	CCTG	2	8	155405	155412	0 %	25 %	25 %	50 %	340783787
2993	NC_015851	GTC	2	6	155499	155504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
2994	NC_015851	ACG	2	6	155525	155530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
2995	NC_015851	CTT	2	6	155557	155562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783787
2996	NC_015851	ATC	2	6	155570	155575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
2997	NC_015851	GCT	2	6	155600	155605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
2998	NC_015851	CAGC	2	8	155665	155672	25 %	0 %	25 %	50 %	340783787
2999	NC_015851	CAG	2	6	155714	155719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3000	NC_015851	GCA	2	6	155766	155771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787

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